2010年机构升格和黄委科研机构整合后，黄科院机关内设机构有7个：办公室、科研管理处、科技推广处、计划财务处、人事劳动处、党群工作处、监察审计处。单列机构有2个：黄河水利委员会黄河超级计算中心、黄河小浪底研究中心。所属机构有10个：泥沙研 究所、水土保持研究所、工程力学研究所、防汛抢险技术研究所、水资源研究所、水力学研究所、江河治理试验中心、引黄灌溉工程技术研究中心、信息工程中心、后勤服务管理中心;共管机构有6个，黄河河口研究院、黄河水资源保护科学研究院、黄河水文水资 源科学研究院、天水水土保持科学试验站、西峰水土保持科学试验站、绥德水土保持科学试验站。

　　黄科院占地面积480多亩，拥有大型试验厅6座，其他试验厅(室)30多个，实验厅(室)总面积达10万m2,拥有先进的科研仪器设备 4000余台(套)。挂靠在黄科院的有： “水利部黄河泥沙重点实验室”、“水利部堤防安全与病害防治工程技术研究中心”、“水利部黄土高原水土流失过程与控制重点实验室”、“水利部黄河计量检定中心水工程计量检定站”、“水利部科技推广中心黄河科技 推广示范基地”、“黄河水利委员会基本建设工程质量检测中心”、“黄河水利委员会科技推广中心”、“黄河泥沙处理与资源利用工程技术研究中心”。

　　同时黄科院设有人力资源和社会保障部和全国博士后管委会共同授予的“黄河水利委员会黄河水利科学研究院博士后科研工作站”和国家研究生教育创新计划“黄河研究生培养基地”。

　　六十多年来，黄科院紧紧围绕国家水利事业的发展和黄河治理开发的需求开展学科建设，学科研究领域不断得到丰富和拓延，已初步形成了以河流泥沙、水土保持、堤防安全与病害防治等为优势学科，以工程力学、防洪减灾与水利管理、水资源与水生态、高新技 术、灌溉与节水技术、水利信息化与测控技术等为支撑学科的创新体系，涵盖专业达60多个。主要研究方向包括：泥沙运动基本理论 ;黄河流域环境演变及泥沙灾害防治;河床演变及河道整治;水库运用方式;河口演变及治理技术;河流数字模拟技术;土壤侵蚀与模拟;水土保持生态工程技术;水土保持监测与效益评价;黄河水沙变化;水资源与水生态;水资源评价理论与方法;流域水资源可 持续利用;流域水资源管理理论与技术，节水理论与技术;水利工程险情预警预报技术;防洪减灾技术;防汛抢险资源配置理论与技术;水利工程管理理论与标准化;防洪工程安全评价、安全检测与隐患探测技术;工程可靠性理论;土力学基本理论;工程物探理论 及技术;水工程材料开发与应用;黄河泥沙处理与资源利用等。

　　黄科院现具有水利部颁发的《水文、水资源调查评价资质证书》(甲级)、《水土保持方案编制资格证书》(甲级)、《水土保持监测资格证书》(甲级)、《建设项目水资源论证资质证书》(甲级)、水土保持设施验收技术评估单位、大中型水库大坝安全评价单 位、大中型水闸安全评价单位、水利水电建设工程蓄水安全鉴定单位、水利工程质量检测单位资质(甲级)、国家认证认可监督管理委员会颁发的《计量认证合格证书》等。

　　六十多年来，黄科院先后承担和完成了包括国家自然科学基金、国家科技支撑计划、国家重点基础研究发展计划(973计划)、国家 高技术研究发展计划(863计划)、国家星火计划、国家引进国际先进农业科学技术计划( 948计划)、国家农业科技成果转化资金 、水利部公益性行业科研专项、水利部科技创新计划、水利部科技推广计划和黄委等资助在内的近5000项研究与开发任务，诸多科研 成果达到国际先进或领先水平。有数百项科研成果获国家、省(部)及黄委奖励;同时在国内外公开发行的刊物上发表了数千篇学术论文，出版科技专(译)著100多部。

　　党和国家领导人非常重视治黄科研工作，1991年和1999年中共中央总书记江泽民曾两次视察黄科院，并欣然题词：“依靠群众，应用科技，治理黄河，造福人民”。温家宝、李克强、回良玉、田纪云、姜春云等党和国家领导人也曾先后亲临视察黄科院。

　　黄科院同美国、英国、法国、荷兰、日本、俄罗斯、意大利、德国、印度等国家建立有良好的学术交流与合作关系，现与美国、荷兰、俄罗斯、乌兹别克斯坦、赤道几内亚、厄瓜多尔等国家开展有科技合作项目。

　　“科学、民主、创新、超越”是黄科院的精神，面向黄河治理开发与经济建设是黄科院的宗旨。我们愿竭诚与国内外有关科研院所、高等院校及规划设计、建设与管理单位密切合作，在水利水电、交通、农业、石化、生态及其他领域提供优质的服务，共同促进水利 科技的进步和发展。